設計にあたり教育機能を第一に考え校舎棟，体育館を本丸跡地付近に合理的に配置した。敷地は石田城跡であるため高低差が大きく，お濠と石垣に囲まれている。そのため本丸跡に校舎棟，一段下がったグラウンド側に体育館を配置し両者は屋根付きの渡り廊下（スロープ併設）で行き来することが容易となっている。（鉄筋コンクリート造り4階建，延べ面積約11,400m²）
　（長崎県土木部提供）